Có 63 loài được ghi nhận trong chi này.

• Melanotaenia affinis M. C. W. Weber, 1907
• Melanotaenia ajamaruensis G. R. Allen & N. J. Cross, 1980
• Melanotaenia ammeri G. R. Allen, Unmack & Hadiaty, 2008
• Melanotaenia angfa G. R. Allen, 1990
• Melanotaenia arfakensis G. R. Allen, 1990 * Melanotaenia arguni Kadarusman, Hadiaty, Ségura, Setia Wibawa, D. Caruso, Pouyaud, 2012[1]
• Melanotaenia australis Castelnau, 1875
• Melanotaenia batanta G. R. Allen & Renyaan, 1998
• Melanotaenia boesemani G. R. Allen & N. J. Cross, 1980
• Melanotaenia caerulea G. R. Allen, 1996
• Melanotaenia catherinae de Beaufort, 1910
• Melanotaenia corona G. R. Allen, 1982
• Melanotaenia duboulayi Castelnau, 1878
• Melanotaenia eachamensis G. R. Allen & N. J. Cross, 1982
• Melanotaenia ericrobertsi G. R. Allen, Unmack & Hadiaty, 2014[2]
• Melanotaenia exquisita G. R. Allen, 1978
• Melanotaenia fasinensis Kadarusman, Sudarto, Paradis & Pouyaud, 2010[3]
• Melanotaenia flavipinnis G. R. Allen, Hadiaty & Unmack, 2014[4]
• Melanotaenia fluviatilis Castelnau, 1878
• Melanotaenia fredericki Fowler, 1939
• Melanotaenia goldiei W. J. Macleay, 1883
• Melanotaenia gracilis G. R. Allen, 1978
• Melanotaenia herbertaxelrodi G. R. Allen, 1981
• Melanotaenia irianjaya G. R. Allen, 1985
• Melanotaenia iris G. R. Allen, 1987
• Melanotaenia japenensis G. R. Allen & N. J. Cross, 1980
• Melanotaenia kamaka G. R. Allen & Renyaan, 1996
• Melanotaenia kokasensis G. R. Allen, Unmack & Hadiaty, 2008
• Melanotaenia lacustris Munro, 1964
• Melanotaenia lakamora G. R. Allen & Renyaan, 1996
• Melanotaenia laticlavia G. R. Allen, Unmack & Hadiaty, 2014[2]
• Melanotaenia maccullochi J. D. Ogilby, 1915
• Melanotaenia mairasi G. R. Allen & Hadiaty, 2011
• Melanotaenia maylandi G. R. Allen, 1983
• Melanotaenia misoolensis G. R. Allen, 1982
• Melanotaenia monticola G. R. Allen, 1980
• Melanotaenia mubiensis G. R. Allen, 1996
• Melanotaenia multiradiata G. R. Allen, Unmack & Hadiaty, 2014[2]
• Melanotaenia nigrans J. Richardson, 1843
• Melanotaenia ogilbyi M. C. W. Weber, 1910
• Melanotaenia oktediensis G. R. Allen & N. J. Cross, 1980
• Melanotaenia papuae G. R. Allen, 1981
• Melanotaenia parkinsoni G. R. Allen, 1980
• Melanotaenia parva G. R. Allen, 1990
• Melanotaenia pierucciae G. R. Allen & Renyaan, 1996
• Melanotaenia pimaensis G. R. Allen, 1981
• Melanotaenia praecox M. C. W. Weber & de Beaufort, 1922
• Melanotaenia pygmaea G. R. Allen, 1978
• Melanotaenia rubripinnis G. R. Allen & Renyaan, 1998
• Melanotaenia salawati Kadarusman, Sudarto, Slembrouck & Pouyaud, 2011
• Melanotaenia sexlineata Munro, 1964
• Melanotaenia sneideri G. R. Allen & Hadiaty, 2013[5]
• Melanotaenia solata W. R. Taylor, 1964
• Melanotaenia splendida W. K. H. Peters, 1866
  • M. s. inornata Castelnau, 1875
  • M. s. rubrostriata E. P. Ramsay & J. D. Ogilby, 1886
  • M. s. splendida W. K. H. Peters, 1866
  • M. s. tatei Zietz (fi), 1896
• Melanotaenia sylvatica G. R. Allen, 1997
• Melanotaenia synergos G. R. Allen & Unmack, 2008[6]
• Melanotaenia trifasciata Rendahl (de), 1922
• Melanotaenia urisa Kadarusman, Hadiaty, Ségura, Setia Wibawa, D. Caruso, Pouyaud, 2012[1]
• Melanotaenia utcheensis McGuigen, 2001
• Melanotaenia vanheurni M. C. W. Weber & de Beaufort, 1922
• Melanotaenia veoliae Kadarusman, Hadiaty, Ségura, Setia Wibawa, D. Caruso, Pouyaud, 2012[1]
• Melanotaenia wanoma Kadarusman, Hadiaty, Ségura, Setia Wibawa, D. Caruso, Pouyaud, 2012[1]